发射入轨后，“思源二号”的首要任务是与嫦娥六号安全分离。分离之后，将进行对月成像任务，继续捕捉月球及地月合影的数据，并进入环月大椭圆轨道。在此过程中，“思源二号”卫星将开展一系列实验，包括使用其微型相机获取月球表面的详细图像、开展图像在轨数据智能处理、纳卫星级别深空月地通信等新技术验证，充分探索基于微纳卫星的低成本深空探测模式。
探月卫星发射的背后，也离不开交大师生团队的付出。上海交大航空航天学院教授吴树范主要从事飞行器导航制导与控制、智能微纳卫星、空间科学与深空探测等领域的技术创新和应用探索，他带领团队多年从事微小卫星技术的研究与试验。2021年10月，吴树范教授带队研发的交大首颗学生卫星APSCO-SSS-2A（SJTU思源一号）成功发射。
“当看到卫星伴随着嫦娥六号升空，就像看到孩子呱呱落地一般，喜悦而庄严。”学生易纪元动情地形容，“伴随着火箭轰鸣声，那一刻，仿佛时间停止了，只留下了火箭在夜空中划过的痕迹。火焰的喷射、烟雾的升腾，构成了一幅绚丽多彩的画面，那是一种对未知的探索，对未来的期待，对人类勇气和智慧的敬佩。我会继续学好专业知识，将自己融入祖国的航天事业中，就像卫星的一颗螺丝钉，火箭的一滴燃料，平凡却也伟大！”
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